新疆的平均海拔爲900米，新疆的最低點吐魯番艾丁湖低於海平面155米，也是中國的陸地最低點；最高點喬戈裏峯位於克什米爾邊境上，海拔8611米。新疆北部有阿爾泰山，南部有崑崙山、阿爾金山和天山。天山作爲新疆象徵，橫貫中部，形成南部的塔里木盆地和北部的準噶爾盆地。山脈與盆地相間排列盆地與高山環抱、喻稱“三山夾二盆”。北部阿爾泰山，南部爲崑崙山系；天山橫亙於新疆中部，把新疆分爲南北兩半，南部是塔里木盆地，北部是準噶爾盆地。習慣上稱天山以南爲南疆，天山以北爲北疆，把哈密、吐魯番盆地爲東疆。
