內質網和高爾基體只是對核糖體合成的蛋白質進行加工修飾，所以只有核糖體合成蛋白質。
核糖體被人們稱作蛋白質的裝配機器。核糖體分兩種，一種是遊離核糖體，另一種是內質網上的核糖體。遊離核糖體合成細胞內蛋白質，而內質網上的核糖體合成分泌性蛋白質。所以蛋白質的合成場所是核糖體，而內質網上由於附有核糖體和所需的酶，所以可以進行蛋白質的合成及後期加工。蛋白質在覈糖體上合成後，進入內質網腔，要經過一些加工如摺疊、組裝、加上一些糖基團等，才能成爲較成熟的蛋白質。然後這些蛋白質被轉移到高爾基體腔內，做進一步加工，整個過程中由線粒體供能，最終形成成熟的蛋白質。
