主要由於語言與文獻的消失。古埃及被馬其頓亞歷山大征服，進入“希臘化”時代，希臘語成爲官方語言，古埃及語言文字受到的影響逐漸擴大。公元前1世紀下半葉羅馬征服埃及後，埃及古文獻在羅馬內戰中大部被毀，拉丁語的推行更擠壓了古埃及語的存在空間，尤其是基督教被確立爲羅馬帝國官方宗教後，對古埃及語言文化影響重大的多神教受到壓制。
529年查士丁尼皇帝關閉了所有多神教與世俗文化中心，古埃及文化更加式微。644年埃及被新興的阿拉伯勢力征服，居民改用阿拉伯語言，改信伊斯蘭教，古文獻再次遭到毀壞，最終蕩然無存。
語言與文獻的消失，使得以語言與文獻爲載體的傳統信仰與價值觀念隨之消失；伊斯蘭教的確立更使得埃及成爲穆斯林世界的一部分，古埃及文明遺產所承載的信仰與價值觀不復存在。
