第八阿賴耶識獨立軀體並不存在，獨立軀體主要是指根本識，其他識的起源。唯識論認爲，阿賴耶識中藏有無數的種子，可以引發人的善惡行爲（主要指思維活動）。自無始以來，阿賴耶識就有淨、染、萬有種子，對待萬物待緣而起這一真理不明瞭，故稱作“無明”。此“無明”是產生其他無明的根本，所以又稱爲“無始”（根本）無明，並由此產生人、法二我執等煩惱的枝末無明，而這一切都是阿賴耶識的本能狀態。當阿賴耶識擺脫了人、法二執，破除見思、塵沙、無明之惑後，就脫離一切虛妄而證得真如的不生不滅、不垢不染、無性無相的法性真實境界。阿賴耶識轉染成淨即是真如。
