1、牧雲笙結局是他放棄了皇位，去找心愛的女人了。在《海上牧雲記》的大結局中，牧雲笙選擇在牢獄中居住，他不理朝中之事，將所有的事情交給虞心忌打理，並且讓他把金珠送到牢房裏。
2、在牢房裏牧雲笙將所有的金珠扔到地上，並且釋放出籠中的金蟲，讓它們食用金珠。牧雲笙在崩塌的地板下發現了一塊玉，這塊玉精緻美豔，似乎有着另外的意義。牧雲笙並不知道這塊玉就是傳國玉璽，只是覺得它渾然天成是世間罕見的珍品。
3、正在這時，龍錦煥來到牢房，他提起了二人在昔日的約定，希望牧雲笙能夠按照約定幫助魅族開設淨土。牧雲笙覺得盼兮既然已經死去，龍錦煥以前說的就都是謊言而已。龍錦換拿出了手中的白色曼陀羅，他告訴牧雲笙，盼兮有復活有可能，她的精神遊絲會在開滿曼陀羅花的地方重新凝結成身體。
