1、僵苗。
僵苗是西瓜苗期主要的生理障礙。發生原因：苗牀氣溫低，特別是土壤溫度低，不能滿足西瓜根系的基本溫度要求。育苗牀土質粘重，土壤含水量高，在溼度大、通風不良的根區條件下發根困難，根的吸收能力差，定植後連續陰雨，僵苗發生尤其嚴重。營養土配製不當。苗牀或種植穴施用未經腐熟或未充分摻勻的有機肥而引起燒根或施用化肥過多，或化肥施於根部較近，土壤溶液濃度較高而傷根。
2、徒長苗。
發生原因：西瓜苗牀光照不足，溫度過高，土壤和空氣溼度高，嫁接西瓜育苗過程中，砧木、接穗在溫、光、氣控制不當時，易出現徒長苗。徒長苗對低溫適應性差，容易發生凍害。
3、漚根。
主要發生在幼苗根部或莖部，是西瓜育苗期常見的一種生理性病害。發生漚根時，根部不發新根或不定根，根部變褐後腐爛，子葉和新葉變薄，呈黃褐色或乳黃色，葉緣焦枯，地上部萎蔫。
