1、會計要素不同：預收賬款科目屬於負債類科目，增加記貸方，減少記借方；預付賬款科目屬於資產類科目，增加記借方，減少記貸方。
2、定義不同:
預收賬款是提前收款的意思。預收賬款科目覈算企業按照合同規定或交易雙方之約定，而向購買單位或接受勞務的單位在未發出商品或提供勞務時預收的款項。
預付賬款是提前付款的意思。預付賬款是指企業按照購貨合同的規定，預先以貨幣資金或貨幣等價物支付供應單位的款項。在日常覈算中，預付賬款按實際付出的金額入賬，如預付的材料、商品採購貨款、必須預先發放的在以後收回的農副產品預購定金等。
3、覈算的內容不同
預收是覈算預收的貨款、預收購貨定金等。預付一般覈算預付的貨款、預付的購貨定金。
