藍菠蘿魚可以從以下5方面區別公母：1、看泄殖腔：在臀鰭後，泄殖腔凹進去的是雌性，泄殖腔凸出來的是雄性；2、摸魚鰓蓋骨：鰓蓋骨有粗糙感覺是雄性，即所謂生殖季節有珠星；3、看尾鰭或臀鰭：有很長鰭的是雄性，沒有的是雌性；4、看個體：個體較小的爲雄性，個體較大的是雌性；5、看肚子：在生殖季節肚子較扁的是雄性，較鼓的是雌性。
