種子萌發時胚根最先突破種皮。種子的主要結構是胚，胚由胚芽、胚軸、胚根、子葉四部分構成，胚根最先突破種皮，發育成植物的根。胚芽發育成莖和葉，胚軸伸長，發育成連接根和莖的部分。
種子種子是種子植物的胚珠經受精後長成的結構，一般有種皮、胚和胚乳等組成。胚是種子中最主要的部分，萌發後長成新的個體。胚乳含有營養物質。種子是裸子植物、被子植物特有的繁殖體，由胚珠經過傳粉受精形成。
種子形態種子的大小、形狀、顏色因種類不同而異。椰子的種子很大，油菜、芝麻的種子較小，而菸草、馬齒莧、蘭科植物的種子則更小。蠶豆、菜豆爲腎臟形，豌豆、龍眼爲圓球狀；花生爲橢圓形；瓜類的種子多爲扁圓形。顏色以褐色和黑色較多，但也有其他顏色。例如豆類種子就有黑、紅、綠、黃、白等色。種子表面有的光滑發亮、也有的暗淡或粗糙。
