珍珠奶茶裏的珍珠是用木薯粉爲原料製作的，正常情況下食用，是不會出現消化不良情況的，只是其在胃部消化的時間較長，一般來說，少量食用珍珠，身體消化功能良好的話，3-4小時就能完全消化並吸收了，若是消化功能較差，那麼消化時間較長，少則6-8小時，多則1天左右。
吃完珍珠後，可以食用一些腸道益生菌，比如：酸奶等，能夠促進胃腸道蠕動，刺激胃酸分泌，從而加快珍珠的消化與吸收。也可飲用一些溫水，幫助食物的排空，從而對珍珠在體內的消化速度有所提升。還可以在吃完珍珠後，食用一些幫助消化的食物，比如：山楂、檸檬等，都可以在一定程度上刺激胃酸分泌，增加腸道的消化率。
