化肥污染防治措施是應強化環保意識，加強土壤肥料的監測管理；增施有機肥；推廣配方施肥技術；加強土壤肥料監測和管理注重管理；施用化肥增效劑；改進施肥方法。施用化肥時，如果使用適當，對農作物有顯着的增產效果。
