清代兩廣總督的前身爲順治元年所置的廣東總督，當時總督駐廣州，兼轄廣西。順治十二年，總督府遷往梧州。康熙二年，別置廣西總督，廣東總督移駐廉州。次年，撤銷廣西總督，廣西政務復歸廣東總督管轄，廣東總督遷駐肇慶。雍正元年，重設廣西總督，次年再次裁撤。雍正七年，爲統一西南軍事指揮權，鎮壓苗族起事，廣西政務暫歸雲貴總督兼轄。雍正十二年，廣西政務仍隸廣東總督管轄，更號兩廣總督。乾隆十一年，兩廣總督遷駐廣州。
