生物發酵工藝流程圖包括以下幾個部分:上游過程、發酵過程以及下游過程。1、上游過程:菌種的選育、培養基配方優化和培養條件優化;菌種的製備。2、發酵過程:發酵過程的控制與優化,污染的防控。3、下游過程:產物的分離純化;三廢處理。