小股東保護自己的權利的措施和制度有：可以對公司會計賬簿進行查閱，有限責任公司的股東可以要求查閱公司會計賬簿；可以去人民法院申請確認股東會、董事會決議無效，或對股東會、董事會決議申請撤銷；特殊情況下，股東可以去法院申請解散公司；可以要求退股，股東與公司不能達成股權收購協議的，股東可以向人民法院提起訴訟。
法律依據：《中華人民共和國公司法》第三十三條股東有權查閱、複製公司章程、股東會會議記錄、董事會會議決議、監事會會議決議和財務會計報告。股東可以要求查閱公司會計賬簿。股東要求查閱公司會計賬簿的，應當向公司提出書面請求，說明目的。公司有合理根據認爲股東查閱會計賬簿有不正當目的，可能損害公司合法利益的，可以拒絕提供查閱，並應當自股東提出書面請求之日起十五日內書面答覆股東並說明理由。公司拒絕提供查閱的，股東可以請求人民法院要求公司提供查閱。
