個體小超市進行成本覈算的方法如下:1、商品進貨時的價格、稅金使用獨立的賬本記錄在冊;2、開業期間的房租、水電費、管理人員的工資使用獨立的賬本記錄在冊;3、開業期間的現金銷售每天進行盤賬,將現金銷售流水資金使用獨立的賬本記錄在冊;4、月底時將三本獨立的賬冊進行整體覈算,並將當月的成本覈算結果記錄在獨立的賬冊。