東非大裂谷南起贊比西河的下游谷地，向北延伸到馬拉維湖北部，並在此分爲東西兩條。東面的一條是主裂谷，穿越坦桑尼亞中部的埃亞西湖、納特龍湖等，經肯尼亞北部的圖爾卡納湖以及埃塞俄比亞高原中部的阿巴亞湖、茲懷湖等，繼續向北直抵紅海和亞西灣，全長5000多公里。西面的一條經坦噶尼喀湖、基伍湖、愛德華湖、艾爾伯特湖等一直到蘇丹境內的白尼羅河促進，全長1700多公里。由於這條大裂谷在地理上已經實際超過東非的範圍，一直延伸到死海地區，因此也有人將其稱之爲“非洲—阿拉伯裂谷系統”。
