人工溼地的工藝原理是利用自然生態系統中物理、化學和生物的三重共同作用來實現對污水的淨化。這種溼地系統是在一定長寬比及底面有坡度的窪地中，由土壤和填料混合組成填料牀，污染水可以在牀體的填料縫隙中曲折流動，或在牀體表面流動。
在不同材質、不同粒徑配比的基質填料上種植特定的處理性能好、成活率高的淨水植物，形成一個獨特的動植物生態環境，對污染水進行處理，從而成爲人工建造的、可控制的、工程化的溼地生態系統。當污水通過溼地系統時，其中的污染物質通過沉積、過濾、吸附和分解等作用得到淨化。
同時，人工溼地中的植物除了增加溼地基質的透水性，還能與周圍環境的原生動物、微生物等形成各種小環境，通過氧的傳遞，形成特殊的根際微生態環境，這一微生態環境具有很強的淨化廢水的能力。
