做微生物檢測，無菌室不是必須的。可按實際情況確定是不是必須要使用無菌室。無菌室一般爲4~5平方米、高2.5米的獨立小房間（與外間隔離），專闢於微生物實驗室內，可以用板材和玻璃建造。無菌室外要設一個緩衝間，錯開門向，以免氣流帶進雜菌。無菌室和緩衝間都必須密閉、室內裝備的換氣設備必須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環境和無菌材料後，只有保持無菌狀態，才能對某種特定的已知微生物進行研究。
