1、作廢增值稅專用發票最重要的是在開票系統裏作廢，在發票填開窗口裏有個發票作廢一欄，單點需要作廢的發票，將其點成深色，再點擊下面的作廢按鈕，這張發票就在稅務系統裏作廢了，這才叫真正的作廢，就可以不用上稅了。然後再對紙質發票作廢，這就是次要的了，如果單位有作廢章，蓋作廢章看起來正規點，如果單位沒有作廢章，就直接用筆寫在發票上（發票自帶複寫，每一張都作廢了），然後將作廢的三聯發票保管好（很重要，一定不能遺失），留單位備查就行了。2、作廢發票必須是當月的發票，如果跨月的發票，是不可能作廢的（金稅系統裏是不認可的），只能採取開紅字的方式沖掉該發票（開紅衝發票有專門的手續）。
