硝化菌開瓶最好儘快用完，打開硝化菌瓶子後空氣中有各種細菌會污染，硝化菌要放在避光的地方，溫度大概在23攝氏度到29攝氏度之間，會延長保存期限。硝化菌是好氧性細菌，包括亞硝酸菌和硝酸菌。生活在有氧的水中或砂層中，在氮循環水質淨化過程中很重要。硝化細菌的存活需要水分和氧氣，所以只能生活在生化棉、生化球、玻璃環、陶瓷環等各種有微孔的濾材中。同時滿足水分與氧氣的供應，它們才能存活。
