原因不同，激活因子不同、激活因子來源不同等。
1、原因不同
內源性凝血若凝血過程由於血管內膜損傷；內源性凝血若凝血過程由於血管內膜損傷。內源性凝血通常因血液與帶負電荷的異物表面(如玻璃、白陶土、硫酸酯、膠原等)接觸而啓動。外源性凝血這一過程是從組織因子暴露於血液而啓動，到因子Ⅹ被激活的過程。
2、激活因子不同
內源性凝血從因子Ⅻ的激活開始；外源性凝血由組織損傷釋放因子Ⅲ而開始。組織因子是存在於多種細胞質膜中的一種特異性跨膜蛋白。當組織損傷後，釋放該因子，在鈣離子的參與下，它與因子Ⅶ一起形成1：1複合物。
3、激活因子來源不同
內源性凝血激活因子全部來源於血漿；外源性凝血途徑是指參加的凝血因子並非全部存在於血液中，還有外來的凝血因子參與止血。外源性凝血所需的時間短，反應迅速。外源性凝血途徑主要受組織因子途徑抑制物(TFPI，一種糖蛋白)調節。外源性凝血途徑參與的外來因子有血小板等。
