雌雄異株可以自交，除此之外，雌雄同株、自花傳粉、異花傳粉都能自交。自交，是指來自同一個體的雌雄配子的結合或具有相同基因型個體間的交配，或來自同一無性繁殖系的個體間的交配。顯花植物雌雄同株十分普遍，因此，自交也很普遍。雌雄同花植物的自花授粉或雌雄異花的同株授粉均爲自交；動物，由於多爲雌雄異體，所以基因型相同的個體間的交配即爲自交，其含意較植物要廣泛些。
一般來說，一年生植物的自交率比多年生草本植物高，而多年生草本植物又比木本植物的自交率高。從理論上來說，自交率越高，分配在雄性器官上的資源比例可能越低，就越有利於種羣的快速增殖。
