蜜糖變黑的原因是蜂蜜主要是糖類，糖類的主要化學元素是碳、氫、氧，氫氧結合變成水，留下來的碳的成份比較多，碳的顏色是黑的。蜜蜂從植物的花中採取含水量約爲75%的花蜜或分泌物，存入自己第二個胃中，在體內多種轉化的作用下，經過15天左右反覆醞釀各種維生素、礦物質和氨基酸豐富到一定的數值時，同時把花蜜中的多糖轉變成人體可直接吸收的單糖葡萄糖、果糖，水分含量少於23%存貯到巢洞中，用蜂蠟密封。
