馬鈴薯含有一些有毒的生物鹼，主要是茄鹼和毛殼黴鹼，但一般經過170℃的高溫烹調，有毒物質就會分解。馬鈴薯含龍葵素（solanine），致毒成分爲茄鹼（C45H73O15N），又稱馬鈴薯毒素，未成熟、青紫皮的馬鈴薯或發芽馬鈴薯含龍葵甙增至25～60mg，甚至高達430mg，所以大量食用未成熟或發芽馬鈴薯可引起急性中毒。薯類尤其是土豆，含有一種叫生物鹼爲有毒物質，人體攝入大量的生物鹼，會引起中毒、噁心、腹瀉等反應。這種有毒的化合物，通常多集中在土豆皮裏，因此食用時一定要去皮，特別是要削淨已變綠的皮。孕婦經常食用生物鹼含量較高的薯類，蓄積在體內就可能導致胎兒畸形。當然，人的個體差異相當大，並非每個人食用了薯類都會發生異常，但是孕婦還是以不吃或少吃薯類爲好，特別是不吃長期貯存、發芽的薯類，這一點對處於妊娠早期的婦女來說尤其重要。
