先天瘻管不算太嚴重的疾病，手術切除瘻管就不會有問題了，但前提是手術要切除乾淨。每次切開引流只是急性化膿時的臨時措施，不能解決再發的問題。發作次數越多，手術越困難，手術切不乾淨的機率就加大，所以要儘快進行手術。
