四個中心一體化指的是業務集中審覈中心、監管通關中心、風險防控中心和企業認證和稽覈查中心。全面完成各項改革目標，形成一體化通關業務管理格局。對現有通關流程進行再造、機構進行重組、制度進行重構。
業務集中審覈中心：通過“互聯網”技術，將海關各類行政審批、內部覈批以及備案業務集中在一起。企業辦理各種手續時不再需要往返多個部門之間，在中心內即可享受到“一站式辦公、一條龍服務”，節省時間成本和人力成本。
風險防控中心：發揮一個統籌各類信息進行綜合分析、統一下達查驗指令的作用。
監管通關中心：統一對烏魯木齊市、昌吉州、吐魯番市的進出口貨物、物品進行監管查驗，同時對全疆H986和X光機機檢圖像進行集中審覈分析。
企業認證和稽覈查中心：將過去由各隸屬海關負責開展的相關稽覈、認證工作，統一到中心來集中開展。
