衛生協管員的主要工作任務有如下幾項：
1、負責本鄉鎮，社區食品衛生，學校衛生，化妝品衛生，生活飲用水衛生，醫療衛生和公共場所衛生，職業放射衛生等摸底調查，建立本底資料檔案。
2、協助區縣衛生局衛生監督所開展本鄉鎮，社區醫療衛生和公共衛生領域日常監督檢查。
3、開展本鄉鎮，社區衛生許可現場初步審查。
4、按照縣衛生局的要求負責本鄉鎮，社區管理相對人衛生法律法規和基本衛生知識宣傳。
5、按照縣衛生監督機構的要求負責本鄉鎮，社區衛生監督相關信息的收集和報送。
6、負責本鄉鎮，社區羣衆舉報投訴的登記，報告和協助縣衛生局開展羣衆舉報，突發公共衛生事件基本情況調查。
7、協助縣衛生局衛生監督所參與本鄉鎮，社區衛生違法案件的初始調查和處理。
8、協助縣衛生局衛生監督所在本鄉鎮，社區的衛生專項執法檢查行動。
9、完成縣衛生局交辦的其他衛生監督工作。
