如果第自然人股東撤資，如果被撤資企業是非合夥企業，那麼自然人股東需繳納印花稅和財產轉讓所得的個稅，稅率20%。應納稅所得額=個人取得的股權轉讓收入、違約金、補償金、賠償金及以其他名目收回款項合計數-原實際出資額（投入額）及相關稅費；如果是法人股東撤資，則會涉及繳納印花稅和企業所得稅。
