在法律認定的角度，分居協議不能約束夫妻是否出軌的事項，僅是認定感情破裂的證據。但是隻要是出軌就是不合法的。
【法律依據】
《婚姻法》第三十二條：男女一方要求離婚的，可由有關部門進行調解或直接向人民法院提出離婚訴訟。人民法院審理離婚案件，應當進行調解;如感情確已破裂，調解無效，應准予離婚。有下列情形之一，調解無效的，應准予離婚：
1、重婚或有配偶者與他人同居的;
2、實施家庭暴力或虐待、遺棄家庭成員的;
3、有賭博、吸毒等惡習屢教不改的;
4、因感情不和分居滿二年的;
5、其他導致夫妻感情破裂的情形。
6、一方被宣告失蹤，另一方提出離婚訴訟的，應准予離婚。
