三層搖搖杯的使用方法是將蛋白質粉倒入杯中，然後加入適量的溫水，最後蓋上過濾蓋，這樣搖一搖後，就可以喝了。三層搖搖杯分爲好幾個部分組成，其中面積最大的可以裝入水。相對而言，其中彈簧狀的物體是攪拌器，它是由不鏽鋼做成的產品，能夠快速的攪拌搖搖杯內的物質，而且隔絕電源性能很好，與很多的化學物質都不產生反應，也沒有毒害。
