南板藍根和板藍根區別有：
1、來源不同，板藍根又稱北板藍根，爲十字花科植物菘藍的乾燥根，氣味微甜而苦澀。南板藍根爲爵牀科植物馬藍的根及根莖，氣微，味淡，在南方地區也作板藍根使用。2、二者藥性、功效、應用基本相同，具有清熱解毒，涼血利咽之功效，都可用於外感發熱，咽喉腫痛。3、所含成分不同，北板藍根含有芥子苷、靛藍、靛玉紅。南板藍根則不含芥子苷。芥子苷爲抑菌成分，因此，北板藍根比南板藍根而言，具有對革蘭氏陽性菌、革蘭氏陰性菌、腮腺病毒有作用。現今市面上出售的複方板藍根顆粒也有兩種，一種以北板藍根爲主藥，一種以南板藍根爲主藥。如果是細菌性感染，要買北板藍根爲主藥的複方板藍根顆粒。
