根據《房屋登記辦法》的規定，因合法建造房屋申請房屋所有權初始登記的，辦理流程如下：(一)申請人提交下列材料提出申請；(二)受理，提交農村房產證辦理需要提交的材料後，工作人員會受理；(三)公告；(四)審覈；(五)收費；(六)記載於登記簿；(七)發證申請村民住房所有權初始登記的，還應當提交申請人屬於房屋所在地農村集體經濟組織成員的證明。
