口服精油一直是非常有爭議的精油使用方式。在芳療臨牀應用中經常被使用到，但其用量、用法都非常嚴謹甚至苛刻。並且有明確的規定，用於治療性質的口服精油，需要有專業醫師資格芳療師的處方纔可以。一般在處理人體消化系統、循環系統問題時會使用到。當然，也不是任何精油、任何病症都可以口服。
而且大家都知道精油不溶於水，所以更不能直接滴入水中或者直接滴入口腔來服用。如果真的需要口服精油，也會需要專業的膠囊或者助溶劑來進行稀釋處理。
口服精油時，肝臟與消化道所分泌的酵素會與不同芳香分子結合，容易引起生化反應，減弱原本可能達到的效果，所以口服效果不一定最好，例如塗抹或吸聞真實薰衣草具安撫、鎮定神經系統、促進皮膚再生的作用，但口服方式反而效果不佳。針對神經、呼吸系統，塗抹或吸聞的效果優於口服。
