南疆的城市有喀什市、阿克蘇市、和田市、阿圖什市、庫爾勒市、阿拉爾市、鐵門關市、圖木舒克市、昆玉市。南疆指新疆天山以南，崑崙山以北的區域，是一個多民族聚居的地區，幅員遼闊，乾旱少雨，塔克拉瑪干沙漠周圍有許多綠洲。
新疆的地形是山脈與盆地相間排列盆地與高山環抱、喻稱三山夾二盆。北部阿爾泰山，南部爲崑崙山系；天山橫亙於新疆中部，把新疆分爲南北兩半，南部是塔里木盆地，北部是準噶爾盆地。習慣上稱天山以南爲南疆，天山以北爲北疆，哈密、吐魯番盆地爲東疆。
新疆的最低點吐魯番艾丁湖低於海平面155米。最高點喬戈裏峯位於克什米爾邊境上，海拔8611米。新疆的古爾班通古特沙漠是陸地上距離海洋最遠的地方，距離最近的海岸線有2648千米。
新疆吉爾吉斯邊境橫貫着天山山脈。吐爾尕特口岸位於邊境。
新疆北部有阿爾泰山，南部有崑崙山、阿爾金山和天山。天山作爲新疆象徵，橫貫中部，形成南部的塔里木盆地和北部的準噶爾盆地。
