1、污染環境：大蒼蠅的個體很大，身體內部的組織物更多，如果用蒼蠅拍拍死了大蒼蠅就會讓蒼蠅體內的各種組織物溢出，污染很大一片地方，所以建議使用殺蟲劑處理大蒼蠅。
2、帶有病毒：蒼蠅的身體裏有蟲卵，特別是大蒼蠅，身體裏的蟲卵更多，如果打死了大蒼蠅就會讓蟲卵掉出來，且蒼蠅攜帶衆多病毒，打死後如果不處理乾淨，會導致病毒傳播。
3、進化弊端：蒼蠅的個體很小，是蒼蠅可以到處傳播繁殖的有利條件，但是大蒼蠅很容易被打死，這是因爲大蒼蠅個體太大，行動緩慢，有一種科學說法是讓蒼蠅體型變大後就更容易被自然界的其他生物消滅，所以保留大蒼蠅會讓蒼蠅演化的體型慢慢變大，這樣更容易消滅蒼蠅這個種羣。
