1、體型：果蠅和蒼蠅同屬雙翅目昆蟲但果蠅的個體與蒼蠅相比就小多了。所以他們是屬於同目但不同種屬的生物，兩者的生活習性有很大差異。
2、危害：果蠅有一定的危害性，這與它的生活習性有關，果蠅喜歡生活在果蔬生長和儲存的地方，但不是存在於果蔬中，而是當果蔬有變質腐爛以後會吸引果蠅去產卵，從而產出小果蠅。蒼蠅水果腐敗了以後它纔會來的，危害不大。
3、物種：蒼蠅幼蟲是蛆，是未成熟體果蠅和蒼蠅幼蟲區別就是這是兩種生物並且一種是發育完全的個體而一個只是幼蟲。
蒼蠅能成功地成爲全球性的害蟲，主要是因爲他們對環境有很強的適應性，和許多昆蟲一樣，幼蠅能從成蠅處獲得不同的食物來源。雌成蠅具有非常靈敏的感應系統，能準確找到溫度和溼度合適的地點產卵，而幼蟲一旦從卵中出來就能找到充足的食物。
此外，蒼蠅卓越的飛行能力和特有的敏捷性使它與許多昆蟲相比具有明顯的優勢，這也是它能在全球廣泛分佈的原因之一。
