關於王允殺了董卓之後爲什麼漢室還是沒有復興的原因主要有兩點：一是不肯赦免董卓部將的罪名，直接導致了李傕等董卓舊部的起兵反叛。
《後漢書·王允傳》記載：允初議赦卓部曲，呂布亦數勸之。既而疑曰：此輩無罪，從其主耳。今若名爲惡逆而特赦之，適足使其自疑，非所以安之之道也。”原來王允也想赦免董卓部曲之罪，但後來又猶豫不決，認爲：這些人知道自己罪大惡極卻蒙朝廷赦免，必然不會相信，反而生疑，不是讓他們安心的好辦法。後來，李傕等人遣使到長安，求乞赦免。王允以爲一歲不可再赦，不許之。
二是王允當政後驕傲自滿，失去百官擁戴。
《後漢書·王允傳》記載：允性剛棱疾惡，初懼董卓豺狼，故折節圖之。卓既殲滅，自謂無復患難，及在際會，每乏溫潤之色，杖正持重，不循權宜之計，是以羣下不甚附之。王允誅殺董卓主要依靠大臣士孫瑞和卓將呂布等的幫助，但誅卓后王允邀爲己功，士孫瑞等不滿，辭官歸鄉。
其實上述兩點並不是王允失敗的主要原因，關於第一點，王允即使不赦免李傕等人，若能派兵討平，自然就沒有後來之亂；關於第二點，雖然因其驕傲自滿，羣下不甚附之”，卻還是支持他的。
所以王允失敗的最主要原因一是沒有及時控制軍隊，二是猶豫不決怠誤時機。
