睾丸炎通常由細菌和病毒引起。睾丸本身很少發生細菌性感染，這是由於睾丸有豐富的血液和淋巴液供應，對細菌感染的抵抗力較強。細菌性睾丸炎大多數是由鄰近的附睾發炎所引起，所以又稱爲附睾-睾丸炎。常見的致病菌是葡萄球菌、鏈球菌、大腸埃希菌等。病毒可以直接侵犯睾丸，最多見是流行性腮腺炎病毒，這種病原體本身主要侵犯兒童的腮腺。但是，這種病毒也好侵犯睾丸，所以常常在流行性腮腺炎發病後不久，容易出現病毒性睾丸炎。此外自身免疫性睾丸炎（experimental autoimmune orchitis，EAO)是生殖免疫學疾病中的一種以睾丸慢性炎症爲主要病理改變的疾病。
