水體污染物的來源主要有：工業廢水、生活污水、農業污水、工業及礦山廢渣、大氣中污染物、天然污染物等。水污染主要是由人類活動產生的污染物造成，它包括工業污染源，農業污染源和生活污染源三大部分。工業廢水是水域的重要污染源，具有量大、面積廣、成分複雜、毒性大、不易淨化、難處理等特點。農業污染源包括牲畜糞便、農藥、化肥等。農藥污水中，一是有機質、植物營養物及病原微生物含量高，二是農藥、化肥含量高。
