海航班大學聯考加分視學員在綜合考覈中的表現而定，具體0到60分不等。在高二暑假之前，每個海航班的學員都必須到山東、遼寧的航校，參加高二年級的綜合考覈。該項綜合考覈爲上機操作考試，即專業飛行員在前面飛，學員則在後面做相同的演示。通過這個上機飛行考覈，學員可獲得0到60分的飛行加分。飛行加分10分爲一檔，主要根據學員的表現而定。
這樣的飛行加分不僅可用於海軍飛行學員的錄取考覈，後期被淘汰的學員也依然可以在普通大學聯考中使用這項加分。考覈中符合條件的學員錄取爲海軍飛行學員，特別優異的可錄取爲海軍和清華大學、北京大學、北京航空航天大學聯合培養的“雙學籍”飛行學員。
