農合醫療可以在北京報銷，前提是要到國家指定的正規的甲等醫院。
辦理手續的步驟如下：1、辦理轉診，分三種情況：第一種情況：在本地發病醫院診治不了的情況下，提出轉診的，到外地定點醫療機構就醫的，轉診時需在本地醫院或者農合辦公室辦理轉診證明書，或是轉出後再轉回本地辦理。第二種情況：如果是外地突發疾病，這種就不需要轉診證明了，只需出院後攜帶病歷和外出證明就可以報銷了。第三種情況：如果是長年在外地，就醫，可以持相關資料回當地報銷。如本人不便回戶籍地，可將齊全的資料寄與委託人代爲辦理。準備材料：（1）患者的《農合證》、戶口本、身份證原件；（2）醫療轉診、轉院審批表（外地務工或外地居住的需提供務工所在單位或居住地村級以上部門證明）；（3）診斷證明；（4）出院證明；（5）住院醫療費用匯總清單；（6）住院收費發票；（7）加蓋公章的住院病歷複印件（包括病歷首頁、長期醫囑、臨時醫囑、出院小結）。
如果是提交代理人代理申請的，還要提交代理人的身份證複印件及與參合病人關係的證明材料。
