線粒體屬於原生質體。原生質體一詞來源於原生質，原生質體是組成細胞的一個形態結構單位。原生質體表示植物細胞壁內的原生質，即指細胞通過質壁分離，能夠和細胞壁分開的那部分細胞物質，包括細胞膜、細胞質和細胞核，換言之原生質體就是除去細胞壁的被細胞膜包圍的“裸露細胞”。現代微生物學中，原生質體是指在人爲條件下，用物理或化學方法除去微生物細胞壁後得到的主要由一層細胞膜包裹着的圓球狀滲透敏感細胞，一般由革蘭氏陽性菌或放線菌、酵母菌、黴菌、蕈菌等形成。而革蘭氏陰性菌去壁後形成與其他微生物原生質體不同的球狀體，也叫原生質球，是指革蘭氏陰性菌在人爲條件下，用溶菌酶破壞細胞壁或用青黴素抑制新生細胞壁合成後，得到的殘留有部分細胞壁的原生質體。
