國家對合作社的惠農政策多雜，按照惠農政策的涵蓋範圍及其特點，這些政策可以三大類：優惠政策、補貼類政策、專項扶持類政策。
優惠政策：合作社可以享受土地流轉補貼、稅收減免、用水用電優惠等優惠政策。
補貼類政策：國家給予農業企業或合作社貸款補貼、購機補貼、種糧補貼及農資綜合補貼等。主要的農業補貼有：種糧直補、農資綜合補貼、生豬標準化規模養殖場建設、農業保險補貼、糧食最低收購政策、退耕還林補貼、草原生態保護補助等等。
專項扶持：國家爲扶持某些產業拿出專項資金，扶持資金力度大，覆蓋範圍相對較小，需要在項目通知後申報爭取。
我國專項扶持比較多，比如：農業綜合開發貸款貼息項目，要求單筆貸款不低於100萬，不高於6000萬。農業綜合開發產業化經營項目、土地治理項目，扶持資金80-160萬。
