長江的入海口在上海市崇明島。長江口水域是上海市重要水源地,同時兼具工農業取水、通航、納污、圍墾、生態等多種功能。長江口已成爲上海市建設世界級城市的重要支撐之一。其水資源的開發、利用和保護已成爲人們關注的焦點。長江口不僅是多種生物週年性溯河和降河洄游的必經通道,也是亞太候鳥遷徙的主要驛站。