吸糞車吸的糞最後處理到垃圾填埋場、污水處理廠。進廠糞便由抽糞車卸入接收池，經過篩分後，污水進入二級生化系統處理，糞便中垃圾等大塊物質分離出來後送入垃圾填埋場處理。剩餘污泥經濃縮與厭氧消化後可以進行堆肥處理，上清液污水進入污水處理系統處理排放，污泥厭氧產生的沼氣可回收利用。該處理方式能對糞便進行完整的無害化處理，處理後各方面指標均可達到國家排放標準。但其建設投資及運行費用均很大，管理較複雜，在沒有城市生活污水處理廠配合處理的情況下，這是對糞便污水進行無害化處理的基本選擇。
