瀋陽藥科大學高等職業技術學院是藥科大學的二級學院。學院位於鐵西區北一西路，佔地面積爲2萬多平方米，建築面積1萬多平方米。學院現有教職工人數169人。其中專任教師73人；教授、副教授33人；中級職稱及以下40人。研究生17人，碩士在讀19人，博士在讀3人。教輔14人，圖書情報人員10人，輔導員教師10人。其餘爲行政管理人員及工人。
瀋陽藥科大學高等職業技術學院，由原遼寧省醫療器械學校演變而來。學院分爲藥學系、醫療器械繫、基礎部二系一部和一個實訓教學中心。設有11個專業：醫用電子儀器與維護、醫療器械製造與維護、藥物製劑技術、藥學、藥物分析、電子商務、生物製藥、藥品經營與管理、製藥設備維修技術、中藥製藥技術、中藥應用技術，有13個教研室。
