有專門清洗美妝蛋的洗潔劑，或者是使用清潔皁。平時也可以使用沐浴露或卸妝液，都可以清洗美妝蛋。在清洗之前先將美妝檔案浸溼，然後再使用清潔劑，雙手進行揉搓，但是要注意力度，最後用溫熱水沖洗乾淨，然後晾乾。美妝蛋會與肌膚直接接觸，所以在第1次買來之後還是需要清洗的，雖然沒有使用過，但是在生產過程中難免會有灰塵。哪怕是美妝蛋上面寫着已經消毒，但是自己清洗一下，還是會更放心的，而且在清洗之後材質會變得更柔軟。
