蚯蚓挖掘土壤，使土壤變鬆，並使空氣和水容易抵達植物的根部。蚯蚓挖掘的洞穴與通道有助於土壤迅速排水。蚯蚓糞中的蚯蚓酶可以殺死土壤中的病毒、有害菌和對植物生長有抑制作用的物質。蚯蚓糞是一種理想的天然生物肥。蚯蚓還能降解、疏散土壤中的污染物。由於污水灌溉，污染塵埃的沉降，加上濫用農藥、化肥，造成了土壤污染，而蚯蚓能在棲息的環境中吸收分解污染物質。
