花甲裏面的黑屎是花甲的腸腺，其中常常會有花甲未完全消化的食物，也會有一些代謝廢物，其腸腺是不能完全去除的，但是若是含有海泥或是觸角上有黑色的泥沙，是可以通過鹽水模擬花甲的生存環境，然後通過花甲自身的新陳代謝將其排乾淨的。
如果時間比較趕，需要快速處理好花甲，那麼可以試試搖晃花甲的方法。首先，用少量料酒和鹽抓洗乾淨，去除表面泥土和殺菌。然後把花甲放在一個鐵容器裏，加入適量的水，然後把另一個大小一樣的容器倒扣在盛有花甲的容器上面，用手開始來回上下搖晃。大力的顛顛它們，這樣花甲顛暈了，沙子就會吐出來了，反覆5次基本上就很乾淨了；最後用流水清洗乾淨就行了。
