吉林師範大學研究生院是具體負責學科建設，博士、碩士學位點建設，研究生招生、培養、學位以及常規管理等工作的行政機構，下設招生辦公室、培養科、專業學位管理科、學位辦公室、學生工作辦公室、學科建設科等6個科室，專職工作人員17名。形成了一支業務水平較高、工作能力較強，具有創新意識和充滿活力的研究生管理團隊。學校從1979年開始招收研究生，1998年獲碩士學位授予權。現有1個服務國家特殊需求“滿族語言文化”博士人才培養項目，13個碩士一級學科，92個碩士二級學科，覆蓋哲學、法學、教育學、文學、歷史學、理學、工學、藝術學8個學科門類。現有吉林省高校重中之重一級學科3個，吉林省高校“十二五”優勢特色重點學科8個，形成了重點突出、富有特色的重點學科系列，學科實力進一步增強，爲高層次人才的培養提供了良好的條件。
